Наскільки знизилася токсичність Омікрону? Численні дослідження в реальних умовах показують

«Вірулентність Омікрону близька до вірулентності сезонного грипу» та «Омікрон значно менш патогенний, ніж Дельта». …… Останнім часом в інтернеті поширюється багато новин про вірулентність нового коронного мутантного штаму Омікрону.

Дійсно, з моменту появи мутантного штаму Omicron у листопаді 2021 року та його глобального поширення, дослідження та обговорення вірулентності та передачі не припиняються. Який поточний профіль вірулентності Omicron? Що про це говорять дослідження?

Різні лабораторні дослідження: Омікрон менш вірулентний
Фактично, ще в січні 2022 року дослідження, проведене медичним факультетом Лі Ка Шінга Гонконзького університету, показало, що Omicron (B.1.1.529) може бути менш патогенним порівняно з вихідним штамом та іншими мутантними штамами.
Було виявлено, що мутантний штам Omicron неефективно використовував трансмембранну серинову протеазу (TMPRSS2), тоді як TMPRSS2 міг сприяти вірусній інвазії клітин хазяїна шляхом розщеплення шипоподібного білка нового коронавірусу. Водночас дослідники спостерігали, що реплікація Omicron значно знижена в лініях клітин людини Calu3 та Caco2.

Джерело зображення інтернет

У мишачій моделі k18-hACE2 реплікація Омікрону була знижена як у верхніх, так і в нижніх дихальних шляхах мишей порівняно з вихідним штамом та мутантом Дельта, а його легенева патологія була менш тяжкою, тоді як інфекція Омікрону спричиняла меншу втрату ваги та смертність, ніж вихідний штам та мутанти Альфа, Бета та Дельта.
Таким чином, дослідники дійшли висновку, що реплікація та патогенність омікронів у мишей були знижені.

Джерело зображення інтернет

16 травня 2022 року журнал Nature опублікував статтю Йосіхіро Каваоки, провідного вірусолога з Токійського університету та Університету Вісконсина, в якій вперше на тваринній моделі підтверджується, що Omicron BA.2 справді менш вірулентний, ніж попередній оригінальний штам.

Дослідники відібрали живі віруси BA.2, виділені в Японії, для інфікування мишей та хом'яків k18-hACE2 та виявили, що після інфікування однаковою дозою вірусу у мишей, інфікованих як BA.2, так і BA.1, титри вірусу в легенях та носі були значно нижчими, ніж у випадку початкової інфекції штамом New Crown (p<0,0001).

Цей результат, що є золотим стандартом, підтверджує, що Омікрон справді менш вірулентний, ніж вихідний дикий тип. Натомість, не було виявлено суттєвої різниці в титрах вірусу в легенях та носах тваринних моделей після інфекцій BA.2 та BA.1.

Джерело зображення інтернет

ПЛР-аналізи вірусного навантаження показали, що миші, інфіковані як BA.2, так і BA.1, мали нижче вірусне навантаження в легенях та носі, ніж оригінальний штам New Crown, особливо в легенях (p < 0,0001).

Подібно до результатів, отриманих у мишей, титри вірусу, виявлені в носі та легенях хом'яків, інфікованих BA.2 та BA.1, були нижчими, ніж у вихідного штаму після «інокуляції» тією ж дозою вірусу, особливо в легенях, і трохи нижчими в носі хом'яків, інфікованих BA.2, ніж у BA.1 – фактично, у половини хом'яків, інфікованих BA.2, не розвинулася легенева інфекція.

Далі було виявлено, що вихідні штами, BA.2 та BA.1, не мали перехресної нейтралізації сироваток після інфікування, що узгоджується з тим, що спостерігалося у реальних людей при інфікуванні різними новими коронними мутантами.

Джерело зображення інтернет

Дані з реального світу: Омікрон рідше викликає серйозні захворювання

У кількох із вищезгаданих досліджень описано знижену вірулентність Омікрону на лабораторних тваринних моделях, але чи те саме стосується реального світу?

7 червня 2022 року ВООЗ опублікувала звіт, в якому оцінюється різниця у тяжкості перебігу захворювання у людей, інфікованих під час епідемії Омікрону (B.1.1.529), порівняно з пандемією Дельта.

У звіті брали участь 16 749 нових пацієнтів з коронарною хворобою з усіх провінцій Південної Африки, зокрема 16 749 пацієнтів під час епідемії Дельта (2 серпня 2021 р. – 3 жовтня 2021 р.) та 17 693 пацієнтів під час епідемії Омікрон (15 листопада 2021 р. – 16 лютого 2022 р.). Пацієнтів також класифікували як тяжких, серйозних та несерйозних.

критичний: отримання інвазивної вентиляції легень, або кисню та високопотокового трансназального кисню, або екстракорпоральної мембранної оксигенації (ЕКМО), або госпіталізація до відділення інтенсивної терапії під час госпіталізації.
-важкий (важкий): отримував кисень під час госпіталізації
-неважкий: якщо жодна з перерахованих вище умов не виконується, пацієнт вважається неважким.

Дані показали, що в групі Дельта 49,2% були у тяжкому стані, 7,7% – у критичному, а 28% усіх госпіталізованих пацієнтів, інфікованих Дельта, померли, тоді як у групі Омікрон 28,1% були у тяжкому стані, 3,7% – у критичному, а 15% усіх госпіталізованих пацієнтів, інфікованих Омікрон, померли. Крім того, медіана тривалості перебування в стаціонарі становила 7 днів у групі Дельта порівняно з 6 днями в групі Омікрон.

Крім того, у звіті проаналізовано фактори впливу віку, статі, статусу вакцинації та супутніх захворювань, і зроблено висновок, що Омікрон (B.1.1.529) був пов'язаний з нижчою ймовірністю серйозних та критичних захворювань (95% ДІ: від 0,41 до 0,46; p <0,001) та нижчим ризиком смерті в лікарні (95% ДІ: від 0,59 до 0,65; p <0,001).

Джерело зображення інтернет

Для різних підтипів Омікрону подальші дослідження також детально проаналізували їхню вірулентність.

У когортному дослідженні з Нової Англії проаналізовано 20770 випадків захворювання на Дельту, 52605 випадків захворювання на Омікрон B.1.1.529 та 29840 випадків захворювання на Омікрон BA.2, і було виявлено, що частка смертей становила 0,7% для Дельти, 0,4% для B.1.1.529 та 0,3% для BA.2. Після коригування на супутні фактори дослідження дійшло висновку, що ризик смерті був значно нижчим для BA.2 порівняно з Дельтою та B.1.1.529.

Джерело зображення інтернет

В іншому дослідженні, проведеному в Південній Африці, оцінювався ризик госпіталізації та ризик тяжкого наслідку для пацієнтів з Дельтою, BA.1, BA.2 та BA.4/BA.5. Результати показали, що з 98 710 нещодавно інфікованих пацієнтів, включених до аналізу, 3825 (3,9%) були госпіталізовані, з яких у 1276 (33,4%) розвинувся тяжкий перебіг захворювання.

Серед інфікованих різними мутаціями, у 57,7% пацієнтів, інфікованих Дельта-мутацією, розвинувся тяжкий перебіг захворювання (97/168), порівняно з 33,7% пацієнтів, інфікованих BA.1 (990/2940), 26,2% пацієнтів, інфікованих BA.2 (167/637), та 27,5% пацієнтів, інфікованих BA.4/BA.5 (22/80). Багатовимірний аналіз показав, що ймовірність розвитку серйозного захворювання серед інфікованих Дельта > BA.1 > BA.2, тоді як ймовірність розвитку серйозного захворювання серед інфікованих BA.4/BA.5 суттєво не відрізнялася порівняно з BA.2.
Знижена вірулентність, але потрібна пильність

Лабораторні дослідження та реальні дані з кількох країн показали, що Омікрон та його підтипи менш вірулентні та рідше викликають серйозні захворювання, ніж вихідний штам та інші мутантні штами.

Однак, в оглядовій статті в січневому випуску журналу The Lancet за 2022 рік під назвою «Легше, але не легко» зазначалося, що хоча інфекція Omicron становила 21% госпіталізацій серед молодого населення Південної Африки, частка спалахів, що спричиняють тяжке захворювання, ймовірно, зростала в популяціях з різним рівнем інфекції та різним рівнем вакцинації. (Тим не менш, у цій загалом молодій популяції Південної Африки 21% госпіталізованих пацієнтів, інфікованих варіантом SARS-CoV-2 omicron, мали тяжкий клінічний результат, і ця частка може зрости та спричинити суттєвий вплив під час спалахів у популяціях з різними демографічними показниками та нижчим рівнем імунітету, отриманого внаслідок інфекції або вакцинації.)

Наприкінці вищезгаданого звіту ВООЗ команда зазначила, що, незважаючи на знижену вірулентність попереднього штаму, майже у третини госпіталізованих пацієнтів з Омікроном (B.1.1.529) розвинувся важкий перебіг захворювання, і що різні нові мутанти корони продовжують спричиняти високу захворюваність та смертність у людей похилого віку, людей з ослабленим імунітетом або невакцинованих. (Ми також хотіли б застерегти, що наш аналіз не слід розглядати як такий, що підтримує наратив про «легкий» варіант. Майже у третини госпіталізованих пацієнтів з Омікроном розвинувся важкий перебіг захворювання, а 15% померли; цифри, які не є незначними……Серед уразливих груп населення, тобто пацієнтів у найвищому віці, у популяціях з високим коморбідним навантаженням, у ослаблених пацієнтів та серед невакцинованих, COVID-19 (усі ЛОС) продовжує сприяти значній захворюваності та смертності.)

Попередні дані Omicron, отримані під час п'ятої хвилі пандемії в Гонконзі, показали, що станом на 4 травня 2022 року з 1192765 нових випадків захворювання під час п'ятої хвилі було 9115 смертей (загальний рівень смертності 0,76%), а загальний рівень смертності для людей старше 60 років становив 2,70% (близько 19,30% цієї вікової групи були невакциновані).

Натомість, лише 2% новозеландців старше 60 років невакциновані, що тісно пов'язано з низьким рівнем смертності від епідемії нової корони на рівні 0,07%.

З іншого боку, хоча часто стверджується, що ньюкаслська лихоманка може стати сезонним ендемічним захворюванням у майбутньому, є науковці-експерти, які дотримуються іншої точки зору.

Троє вчених з Оксфордського університету та Спільного дослідницького центру Європейського Союзу вважають, що менша тяжкість захворювання на Омікрон може бути просто збігом обставин, і що продовження швидкої антигенної еволюції (антигенної еволюції) може призвести до появи нових варіантів.

На відміну від імунного виходу та передачі вірусу, які зазнають сильного еволюційного тиску, вірулентність зазвичай є лише «побічним продуктом» еволюції. Віруси еволюціонують, щоб максимізувати свою здатність до поширення, і це також може призвести до підвищення вірулентності. Наприклад, збільшення вірусного навантаження для полегшення передачі все одно може спричинити важчий перебіг захворювання.

Не тільки це, але вірулентність також завдасть дуже обмеженої шкоди під час поширення вірусу, якщо симптоми, спричинені вірусом, з'являються переважно на пізніх стадіях інфекції – як у випадку з вірусами грипу, ВІЛ та гепатиту С, і це лише деякі з них, які мають достатньо часу для поширення, перш ніж спричинити серйозні наслідки.

Джерело зображення інтернет

За таких обставин може бути важко передбачити тенденцію розвитку нового штаму корон-мутанта через нижчу вірулентність Омікрону, але гарна новина полягає в тому, що нова корон-вакцина продемонструвала знижений ризик тяжкого перебігу захворювання та смерті від усіх мутантних штамів, а агресивне збільшення рівня вакцинації населення залишається важливим способом боротьби з епідемією на цьому етапі.
Подяки: Цю статтю професійно рецензував Панпан Чжоу, доктор філософії, медичний факультет Університету Цінхуа та постдокторант Науково-дослідного інституту Скріппса, США.
Реагент для самостійного тестування антигену Omicron в домашніх умовах