«Вірулентність Omicron близька до сезонного грипу» і «Omicron значно менш патогенний, ніж Delta». …… Останнім часом в Інтернеті шириться багато новин про вірулентність нового штаму коронного мутанта Омікрон.
Дійсно, після появи мутантного штаму Omicron у листопаді 2021 року та його глобального поширення дослідження та обговорення вірулентності та передачі не припиняються. Який зараз профіль вірулентності Omicron? Що про це говорять дослідження?
Різні лабораторні дослідження: Омікрон менш вірулентний
Фактично, ще в січні 2022 року дослідження Медичного факультету Гонконгського університету Лі Ка Шінг показало, що Омікрон (B.1.1.529) може бути менш патогенним порівняно з оригінальним штамом та іншими мутантними штамами.
Було виявлено, що мутантний штам Omicron був неефективним у використанні трансмембранної серинової протеази (TMPRSS2), тоді як TMPRSS2 міг полегшити вірусну інвазію в клітини-господарі, розщеплюючи спайковий білок нового коронавірусу. У той же час дослідники помітили, що реплікація Omicron була значно знижена в лініях людських клітин Calu3 і Caco2.
Джерело зображення в Інтернеті
У мишачій моделі k18-hACE2 реплікація Омікрону була знижена як у верхніх, так і в нижніх дихальних шляхах мишей порівняно з вихідним штамом і мутантом Дельта, а легенева патологія була менш серйозною, тоді як інфекція Омікрон спричинила меншу втрату ваги та смертність, ніж вихідний штам і мутанти Альфа, Бета та Дельта.
Таким чином, дослідники дійшли висновку, що реплікація та патогенність Омікрону були знижені у мишей.
Джерело зображення в Інтернеті
16 травня 2022 року журнал Nature опублікував статтю Йошіхіро Каваока, провідного вірусолога з Токійського та Вісконсінського університетів, у якій вперше на тваринній моделі підтверджено, що Omicron BA.2 справді менш вірулентний, ніж попередній вихідний штам.
Дослідники відібрали живі віруси BA.2, виділені в Японії, для зараження мишей і хом’яків k18-hACE2, і виявили, що після зараження тією ж дозою вірусу миші, інфіковані BA.2 і BA.1, мали значно нижчі титри вірусу в легенях і носі, ніж вихідний штам New Crown (p<0,0001).
Цей результат золотого стандарту підтверджує, що Omicron справді менш вірулентний, ніж вихідний дикий тип. Навпаки, не було суттєвої різниці в титрах вірусу в легенях і носах моделей тварин після інфекцій BA.2 і BA.1.
Джерело зображення в Інтернеті
ПЛР-тести на вірусне навантаження показали, що миші, інфіковані BA.2 і BA.1, мали нижче вірусне навантаження в легенях і носі, ніж вихідний штам New Crown, особливо в легенях (p<0,0001).
Подібно до результатів у мишей, титри вірусу, виявлені в носі та легенях інфікованих BA.2 і BA.1 хом’яків, були нижчими, ніж у вихідного штаму після «інокуляції» тією ж дозою вірусу, особливо в легенях, і трохи нижчими в носі хом’яків, інфікованих BA.2, ніж у BA.1 – фактично у половини хом’яків, інфікованих BA.2, не розвинулася легенева інфекція.
Крім того, було виявлено, що вихідні штами, BA.2 і BA.1, не мали перехресної нейтралізації сироваток крові після інфікування – це відповідає тому, що спостерігалося у реальних людей при інфікуванні різними новими мутантами корони.
Джерело зображення в Інтернеті
Реальні дані: «Омікрон» з меншою ймовірністю спричинить серйозні захворювання
Кілька з наведених вище досліджень описували знижену вірулентність Омікрону на моделях лабораторних тварин, але чи це справедливо в реальному світі?
7 червня 2022 року ВООЗ опублікувала звіт, в якому оцінюється різниця в тяжкості людей, інфікованих під час епідемії Омікрон (B.1.1.529), порівняно з пандемією Дельта.
Звіт включав 16 749 нових коронарних пацієнтів із усіх провінцій Південної Африки, у тому числі 16 749 від епідемії Дельта (2021/8/2 до 2021/10/3) і 17 693 від епідемії Omicron (2021/11/15 до 2022/2/16). Пацієнтів також класифікували як важкі, серйозні та несерйозні.
критично: після інвазивної вентиляції легенів, або кисню та трансназального кисню з високим потоком, або екстракорпоральної мембранної оксигенації (ECMO), або госпіталізації до відділення інтенсивної терапії під час госпіталізації.
-важкий (важкий): отримав кисень під час госпіталізації
-неважкий: якщо не виконується жодна з перерахованих вище умов, пацієнт є неважким.
Дані показали, що в групі Дельта 49,2% були серйозними, 7,7% були критичними і 28% усіх госпіталізованих пацієнтів із дельта-інфекцією померли, тоді як у групі Омікрон 28,1% були серйозними, 3,7% були критичними та 15% усіх госпіталізованих пацієнтів із Омікрон померли. Крім того, середня тривалість перебування становила 7 днів у групі Дельта порівняно з 6 днями в групі Омікрон.
Крім того, у звіті проаналізовано впливові фактори віку, статі, статусу вакцинації та супутніх захворювань і зроблено висновок, що Омікрон (B.1.1.529) був пов’язаний із меншою ймовірністю серйозних і критичних захворювань (95% ДІ: 0,41 до 0,46; p<0,001) і нижчим ризиком смерті в лікарні (95% ДІ: 0,59 до 0,65; p<0,001).
Джерело зображення в Інтернеті
Подальші дослідження також детально проаналізували вірулентність різних підтипів Omicron.
Когортне дослідження в Новій Англії проаналізувало 20770 випадків Delta, 52605 випадків Omicron B.1.1.529 і 29840 випадків Omicron BA.2 і виявило, що частка смертей становила 0,7% для Delta, 0,4% для B.1.1.529 і 0,3% для BA.2. Після коригування факторів, що змішують, дослідження дійшло висновку, що ризик смерті був значно нижчим для BA.2 порівняно з Delta та B.1.1.529.
Джерело зображення в Інтернеті
Інше дослідження, проведене в Південній Африці, оцінювало ризик госпіталізації та ризик важкого результату для Delta, BA.1, BA.2 та BA.4/BA.5. Результати показали, що з 98 710 нових інфікованих пацієнтів, включених до аналізу, 3825 (3,9%) були госпіталізовані, з яких у 1276 (33,4%) розвинулося тяжке захворювання.
Серед пацієнтів, інфікованих різними мутаціями, у 57,7% пацієнтів із дельта-інфекцією розвинулося тяжке захворювання (97/168), у порівнянні з 33,7% пацієнтів, інфікованих BA.1 (990/2940), 26,2% пацієнтів із BA.2 (167/637) і 27,5% пацієнтів із BA.4/BA.5 (22/80). Багатофакторний аналіз показав, що ймовірність розвитку серйозного захворювання серед інфікованих Delta > BA.1 > BA.2, у той час як ймовірність розвитку серйозного захворювання серед інфікованих BA.4/BA.5 істотно не відрізнялася порівняно з BA.2.
Знижена вірулентність, але потрібна пильність
Лабораторні дослідження та реальні дані з кількох країн показали, що «Омікрон» та його підтипи менш вірулентні та з меншою ймовірністю викликають серйозні захворювання, ніж оригінальний штам та інші мутантні штами.
Проте в оглядовій статті у випуску The Lancet за січень 2022 року під назвою «М’якше, але не легко» зазначається, що, хоча інфекція Омікрон спричинила 21% госпіталізацій молодшого населення Південної Африки, частка спалахів, що спричиняють важкі захворювання, ймовірно, зросте в популяціях з різними рівнями інфекції та різними рівнями вакцинації. (Тим не менш, серед цього, як правило, молодого південноафриканського населення, 21% госпіталізованих пацієнтів, інфікованих варіантом омікрон SARS-CoV-2, мали важкий клінічний результат, частка, яка може збільшитися та спричинити значний вплив під час спалахів у популяціях з іншою демографічною структурою та нижчим рівнем імунітету, отриманого від інфекції чи вакцини.)
Наприкінці вищезгаданого звіту ВООЗ команда зазначила, що, незважаючи на знижену вірулентність попереднього штаму, майже у третини госпіталізованих пацієнтів з Омікроном (B.1.1.529) розвинулася важка форма захворювання, і що різні нові мутанти корони продовжують спричиняти високу захворюваність і смертність серед людей похилого віку, людей з ослабленим імунітетом або невакцинованих груп населення. (Ми також хотіли б застерегти, що наш аналіз не слід розглядати як підтримку «легкого» варіанту розповіді. Майже у третини госпіталізованих пацієнтів з Омікроном розвинулася важка форма захворювання, а 15% померли; кількість, яка не є незначною……Серед уразливих груп населення, тобто пацієнтів у крайньому віці, у популяціях із високим тягарем супутніх захворювань, у слабких пацієнтів і серед невакцинованих, COVID-19 (усі ЛОС) продовжує спричиняти значну захворюваність і смертність.)
Попередні дані Omicron, коли він спровокував п’яту хвилю пандемії в Гонконзі, показали, що станом на 4 травня 2022 року було 9115 смертей із 1192765 нових випадків захворювання під час п’ятої хвилі (загальний рівень смертності 0,76%) і загальний рівень смертності 2,70% для людей старше 60 років (приблизно 19,30% цієї вікової групи були невакцинованими).
Навпаки, лише 2% жителів Нової Зеландії старше 60 років не вакциновані, що дуже корелює з низьким рівнем смертності від епідемії нової корони – 0,07%.
З іншого боку, хоча часто стверджують, що Ньюкасл може стати сезонною ендемічною хворобою в майбутньому, є академічні експерти, які дотримуються іншої точки зору.
Троє вчених з Оксфордського університету та Спільного дослідницького центру Європейського Союзу вважають, що нижча тяжкість Омікрону може бути просто збігом обставин, і що тривала швидка антигенна еволюція (антигенна еволюція) може призвести до появи нових варіантів.
На відміну від імунної втечі та трансмісивності, які піддаються сильному еволюційному тиску, вірулентність зазвичай є лише «побічним продуктом» еволюції. Віруси еволюціонують, щоб максимізувати свою здатність до поширення, і це також може призвести до збільшення вірулентності. Наприклад, збільшення вірусного навантаження для полегшення передачі може спричинити більш серйозне захворювання.
Крім того, вірулентність також завдасть дуже обмеженої шкоди під час поширення вірусу, якщо симптоми, викликані вірусом, з’являються в основному пізніше зараження – як у випадку вірусів грипу, ВІЛ і вірусів гепатиту С, щоб назвати декілька, які мають достатньо часу для поширення, перш ніж спричинити серйозні наслідки.
Джерело зображення в Інтернеті
За таких обставин може бути важко передбачити тенденцію розвитку нового штаму коронного мутанта на основі нижчої вірулентності Omicron, але хороша новина полягає в тому, що нова вакцина Crown продемонструвала знижений ризик важких захворювань і смерті проти всіх мутантних штамів, і агресивне збільшення рівня вакцинації населення залишається важливим способом боротьби з епідемією на цьому етапі.
Подяка: цю статтю професійно рецензував Панпан Чжоу, доктор філософії, медична школа Університету Цінхуа та докторант, дослідницький інститут Скріппса, США
Реагент для самотестування на антиген Омікрон в домашніх умовах
Час публікації: 08 грудня 2022 р